目的:探究分析针刺结合经颅磁刺激治疗脑卒中后吞咽障碍的临床疗效。方法:选取于2020年2月至2022年2月，我院收治的脑卒中患者共120例，作为本次研究对象。按照电脑盲选的方式，将120例患者随机分为对照组与观察组。对照组采用常规治疗模式进行干预;观察组采用针刺结合经颅磁刺激的治疗模式进行干预。对比分析对照组与观察组的洼田饮水试验评分;治疗有效率;吞咽功能情况以及NISS评分。结果:经治疗干预后，观察组在洼田饮水试验评分;治疗有效率;吞咽功能情况以及NISS评分方面，优于对照组，其中(P＜0.05)，差异具有统计学意义。结论:对脑卒中后吞咽障碍患者采用针刺结合经颅磁刺激的治疗模式进行干预，能够有效改善患者的洼田饮水试验评分;吞咽功能情况以及NISS评分，提升治疗有效率;改善患者的吞咽功能，在实际应用中具有优良的效果，值得推广与应用。