目的：本次研究主要通过对照医用灭菌器的方式，分析等离子体灭菌器在腹腔镜消毒中的应用效果。方法：随机抽取2021年1月至2022年1月时段内在我院进行腹腔镜消毒的180例样本当作研究对象，根据采用灭菌器的不同进行分组，将采用常规医用灭菌器消毒的90例样本设为对照组，将采用低温等离子体灭菌器消毒的90例样本设为研究组，比较两组灭菌时间、设备成本、灭菌率、腹腔镜清洗质量评分、杀菌灭菌质量评分等。结果：经过消毒后观察发现，灭菌器实际使用情况上对比，研究组灭菌所用时间较短，且每天灭菌器成本较高，P<0.05；灭菌效果比较上，研究组腹腔镜清洗杀毒灭菌质量与灭菌合格率较高，和对照组比较均具有较大差异，P<0.05。结论：医院在进行腹腔镜消毒过程中，选用等离子体灭菌器应用可取得更为理想的灭菌消毒效果。