随着“大众创业”战略的提出与落实，社会人才需求发生了较大的变化，尤其是在当前各行业企业的转型升级环境下，创新创业人才成为推进我国社会经济发展的刚需。基于此，如何更好地培养创新创业人才，成为我国高等教育的重要研究课题，创新创业教育逐渐成为高校的重点教育内容。食品科学专业作为我国高校的重要专业内容，其主要目标是培育食品相关行业的创新应用人才，将创新创业教育融入到这一专业教学中去，能够更好地培养适合新时代社会发展的食品行业人才，进而推动我国食品行业的进一步发展。《食品工厂设计》是食品科学专业课程的重要组成，对于学生专业能力的发展具有重要作用。本文便以《食品工厂设计》课程为例，针对高校食品科学专业教学与创新创业教育融合的困境及原则进行了深入探析，并提出了相应的融合路径，希望能够予以有效借鉴。