目的：通过进行临床对比实验分析临床药学干预抗菌药物合理使用过程中的效果如何。方法：实验对象选自于来医院治疗疾病需要使用抗菌药物的病患共有168人，按照来医院就诊的先后顺序将他们分为两组，一组是测试组有84人，在使用抗菌药物之前加入临床药学的干预措施，另一组是参照组有84人，按照正常诊断结果使用抗菌药物即可。并在实验过程中对比两组病患抗菌药物的不合理使用率，以及两组病患服用抗菌药物治疗疾病的时长。结果：测试组病患不合理用药的概率是9.52%，相比于参照组，具有明显优势（P＜0.05）；测试组病患的治疗时长显著少于参照组且P＜0.05，另外对比两组病患在使用抗菌药物治疗期间，不良反应的发生率测试组的是3.57%，而参照组的不良反应发生率是21.43%，两组之间的差异很明显（P＜0.05）。结论：通过临床实验表明在临床药学干预的前提下，使用抗菌药物的不合理使用率有了很明显的下降，而且也大大减少了药物治疗的时间，有效提高了治疗效率，值得在临床上进行推广使用。