十九届四中全会审议通过了《中共中央关于坚持和完善中国特色社会主义制度、推进国家治理体系和治理能力现代化若干重大问题的决定》，高职院校治理体系是国家治理体系下的重要组成部分，其健康有序发展既是实现国家治理体系现代化的必然要求，也是高职院校实现自身发展的客观要求。2020 年一场突如其来的新冠疫情改变了各类学校以往的教育教学方式。高职院校作为培养专业性、实用型人才的教育场所，如何在这一公共卫生突发事件下保持学校正常运转与其自身的治理体系密不可分。本文将在分析公共卫生突发事件内涵及特征的基础上，结合高职院校治理体系构建的原则，着重探析公共卫生突发事件下的高职院校治理体系构建，旨在为高职院校在此类突发事件下维持正常有序的治理体系提供建议。