混合所有制企业在经营中存在的最大风险当属财务风险，因为混合所有制企业的投资者是由国有资本股东和非公有制股东联姻形成的公司，往往这类企业因历史原因投入不足导致资金周转紧张，偿债能力不足，先天性的运营资金不足与改制后的股权结构形成了与企业经营战略不匹配，造成混合制企业日常营运存在一定的财务风险，很多混合所有制企业一味的采用借新还旧只会增加新的财务风险，如果银行突然断贷公司资金链会出现重大危机，因此，补充要想从根本上解决营运资金问题，出路有四个：一是增资扩股，即通过股权融资解决混合所有制企业投入不足的根本问题；二是股东按出资比例向被投资公司担保或借款，解决运营资金问题，三是根据现有产能压缩营运资金，适当借款以维持基本运营，稳定为主；四是靠企业自身的实力和管理，靠狠抓效率和效益解决资金短板。总之其核心是公司股东坐在一起集思广益达成共识保证混合所有制企业平稳运行，经营层和股东团结一致使其利润最大化。