对于普遍真菌类微生物来说其获取营养的方式主要是通过菌丝，真菌菌丝的组成主要有两种，一种是单个细胞组成，另一种是多个细胞组成，它们均是通过管状细胞壁包裹而成。对于普遍真菌类生物，菌丝内部可以相互交叉，以至于形成单个细胞。中间阻挡它们的隔垫通常会被菌丝钻孔，孔径大小各不相同，形成的这些孔有助于容积核糖体和线粒体等，孔之间相互联通，一些物质还可以在细胞核之间交流。菌丝类微生物与一般为生物相比，比如含有纤维素的细胞壁、卵菌等，真菌细胞壁中的主要结构聚合物通常是几丁质。由于其表面具有孔径，菌丝可以通过渗透作用进入其内部。除此之外，含有菌丝类的真菌的性质也是重要关注对象。在担子菌分类中显示，由菌丝组成的个体、实体可以认为是生殖、骨骼或结合菌丝。