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Thiobacillusthioparus菌株中硫氰酸水解酶生信分析
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摘要:硫氰酸水解酶γ亚基和腈水合酶α亚基同属一个超家族结构域,具有高度同源性。硫氰酸水解酶除了具有水解硫氰酸的活性外,同时也可能具有降解腈类物质的活性,然而在有关于硫氰酸水解酶的研究规模与质量上,皆不如腈水合酶。为了进一步探究硫氰酸水解酶的功能和作用,故通过腈水合酶α亚基特征序列(CTLCSC)为探针,从NCBI上筛选硫氰酸水解酶的蛋白序列,最终筛选出一个来自Thiobacillusthioparus菌株的硫氰酸水解酶,并对其蛋白序列进行生信分析。分析显示该基因编码243个氨基酸,相对分子质量为27.53kD,为亲水性稳定蛋白,存在丝氨酸、酪氨酸和苏氨酸磷酸化位点,含有NHLP先导肽结构域,整体结构域与腈水合酶α亚基同属于thiocyan_alph超家族,蛋白二级结构由α螺旋(37.45%)、延伸链、(11.11%)β转角(4.53%)、无规则卷曲(46.91%)构成,无跨膜螺旋区、信号肽,为细胞质酶,预测硫氰酸水解酶的理化性质,分析与腈水合酶催化口袋的差异,为后续研究提供一定参考。
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