肝细胞癌关键生物标志物的筛选和鉴定—— 来自生物信息分析的证据

王 乾坤
安徽医科大学第一临床医学院

摘要

为探究HCC 发生的分子机制，从GEO 芯片数据集GSE84402 获取肝癌组织和肝癌旁正常组织的数据信息，通过GEO2R 鉴定出差异表达基因(DEGs)，对DEGs进行功能GO富集分析和KEGG通路分析比较，并构建蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)图导入Cytoscape进行模块分析得到Hub基因，分别对Hub基因在cBioPortal用Kaplan-Meier曲线进行总生存期和无病生存期分析，确定关键基因，最后用UCLAN进行验证。结果鉴定出93个基因，其中下调基因68个，上调基因25个。TTK、CYP3A4和MT1G是Hub基因，生存分析显示，TTK是肝癌的关键基因，可能是HCC的候选生物标志物，或成为肝细胞癌基因治疗的靶点，验证后支持上述结果。

关键词

肝细胞癌；差异表达基因；蛋白 - 蛋白相互作用；富集分析；GSE84402

参考

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