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运用网络药理学和分子对接技术分析半边莲对治疗肺癌的作用机制

杨 青斌1, 马 超1, 李 进1, 向 兰1, 徐 静2
1、贵州中医药大学第二附属医院
2、通讯作者贵州中医药大学第二附属医院

摘要


目的:该文章主要运用网络药理学和分子对接技术对半边莲的有效活性成分进行分析,并探讨半边莲抗肺癌的作用机制。基于对 TCMSP 的检索掌握有关半边莲包含的有效成分的相关信息,同时获取其作用靶点数据,在 GeneCards 以及 Drugbank 等多个数据库的支持下,收集一系列肺癌疾病方面的靶点信息,以为文章课题的研究提供切实可行的参考依据,确保课题研究的客观性和真实性。通过对 STRING 数据库文献的引用和参考,顺利实现了对疾病和药物的共同靶点以及蛋白质-蛋白质彼此作用关系网络的建立,为后文研究予以了技术和资料方面的支持。结合 Cytoscape3.7.1 软件提供的一系列功能,成功构建了“成分-靶点-通路”体系,同时将该网络体系运用到对半边莲的抗癌过程和作用机制的探索之中,借助 Matescape 功能模块顺利实现了对其共同靶点和 KEGG 通路的富集处理;除此之外,出于对课题研究严谨性方面的考量,文章还利用了 AutoDock 展开了就活性成分与关键靶点间分子对接情况的探究,获取了所需的实验结果,得到了一系列研究成果。结果表明,筛选得到半边莲主要活性成分 71 个,有效活性成分16 个,药物靶点 189 个,半边莲与肿瘤疾病共同靶点 27 个。蛋白互作图显示,HSP90AAA1、PPARG、PTEN、MYC、NOS3、TGFB1 和 CYP3A4 可能是半边莲治疗癌症疾病的关键靶点。分子对接结果表明,半边莲关键靶点 PPARG 基因的对接亲和力最高,为 38.07 kJ/mol。文章通过对课题的研究,顺利实现了对半边莲的基本药理原理的掌握和认识,分析了该物质在治疗肺癌方面发挥的积极作用,为之后相关研究探索提供了切实可行的参考依据。

关键词


网络药理学;分子对接;半边莲;肺癌;作用机制

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参考


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DOI: http://dx.doi.org/10.12361/2661-3603-04-10-103523

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