牙髓干细胞分化轨迹的构建与差异基因筛选

何 超, 金 轶男, 刘 毅铮, 刘 博玉, 欧 健男
佳木斯大学 黑龙江

摘要

目的：利用GEO数据库中正常牙髓组织的单细胞测序数据，对牙髓间充质干细胞的测序数据经过分离，分析牙髓间充质干细胞的发育轨迹，并探究在其发育过程中影响其分化方向的因素。方法：使用R语言进行进行聚类、分群，提取出其中的牙髓间充质干细胞，并进行二次的聚类、分群，以及伪时序分析，确定出不同时间点的牙髓间充质干细胞的差异基因。结果：对GSE161267数据进行分析，通过降维分群，共分出15群细胞，并鉴定出DPSCs子细胞群，进行二次降维聚类，筛选出了10个变化率最高的基因。伪时序分析的结果表明，DPSCs存在4个初步的分化方向，为成肌分化、成牙分化、成骨分化。其中成牙分化与成骨分化的时间节点相似。结论：DPSCs的分化过程中，ASPN、ACTA2、THY21等基因存在特异性的高表达，且牙髓干细胞成牙分化与成骨分化的节点相似，能够作为诱导分化的最佳时间点。

参考

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