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基于网络药理学及分子对接的丹参抗缺血性中风的作用机制研究

叶 玉清, 胡 丙成, 黄 琪
黑龙江省中医药科学院 黑龙江哈尔滨 150000

摘要


目的:基于网络药理学及分子对接探究丹参抗缺血性中风的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索丹参的有效成分及相关靶点,以“ischemic stroke”、“cerebral infarction”为关键词在 GeneCards 数据库搜索缺血性脑卒中的相关靶点,去除重复项后利用 Venny 2.1.0 在线工具将药物靶点与疾病靶点取交集,获得丹参治疗缺血性脑卒中的潜在靶点,采用 Cytoscape 3.8.0 软件构建药物有效成分-疾病靶点调控网络。并利用 STRING 网站来构建丹参与脑梗死之间的蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络,并进行相应的 GO 富集分析及 KEGG 信号通路分析,用 Autodock 进行分子对接。结果:筛选出丹参有效成分 35 个,与疾病相关成分 30 个,核心成分为丹参酮ⅡA,作用于 76 个靶点。利用 STRING 网站来构建丹参与缺血性中风之间的 PPI 网络,获得核心靶点 TNF、TP53、FOS、MYC、CASP3,经分子对接发现靶点蛋白 TNF、TP53、CASP3 均存在很好的结合作用且匹配度高(结合能小于-6 kcal/mol),其中,丹参酮ⅡA 与 TNF打分值最高,结合最良好。主要通过 TNF 信号通路、脂质和动脉粥样硬化、cAMP 信号通路等通路发挥作用。对丹参治疗缺血性中风的活性组分和机理进行了初步的预测,为丹参在临床治疗缺血性中风进一步提供更多可行性。

关键词


关键词:中风;脑卒中;丹参;网络药理学;分子对接

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参考


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DOI: http://dx.doi.org/10.12361/2661-3603-05-09-131535

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