联合应用空间转录组测序和单细胞测序解密肿瘤微环境

文博 1,, 李明 星1, 张多 力1, 邹 畅3, 肖占 刚4
1 西南医科大学分子药理实验室；2 西南医科大学细胞实验室；3 暨南大学药学院；4 川南医学转化研究院

摘要

摘要：目的：肿瘤微环境（TME）是一个由多种细胞组成的高度复合的动态整体。单细胞测序(SC)是一种可以获取肿瘤微环境高分辨率图像的新兴技术，该技术的缺点之一是不能有效捕捉空间信息。而空间转录组测序(ST)能够记录数据的空间信息，使得分析立体直观，但缺点是分辨率不够高。联合应用单细胞测序和空间转录组测序无疑将为肿瘤微环境的研究提供双重优势，能够在捕获空间信息的同时拥有高分辨率，这不仅有助于肿瘤微环境的解密，也有利于临床的精准诊断和精准治疗。本文回顾了肿瘤微环境、单细胞测序和空间转录组测序的基本知识，并对单细胞测序和空间转录组测序的联合应用进行了总结和展望。

关键词

关键词：肿瘤微环境；单细胞测序；空间转录组测序；精准诊断；精准治疗