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SPOP基因与前列腺癌相关性的生物信息学分析

于  佳1, 马 均柏1, 刘  欢1, 张 景楠2
1、宁夏医科大学基础医学院
2、宁夏医科大学临床医学院

摘要


目的:本研究立足于TCGA的基因数据集,对前列腺癌与基因SPOP的相关数据进行分析,以期为前列腺
癌的基因治疗及分子标志物的最终判定奠定基础。方法:正常组织及前列腺癌组织相关数据取自TCGA公共组学数
据库。利用SPSS 23.0软件进行数据处理,行t检验、χ2
检验和非参数检验对检测指标进行分析比较,以P<0.05为差
异具有统计学意义。结果:1.SPOP在前列腺癌中的表达基于不同的指标,包括患者不同的样本类型、年龄、种族、
格里森分数、淋巴结转移状态和TP53的转移状态等,表达结果各有不同:SPOP在正常组织中的表达明显高于原发
肿瘤,比较具有极显著的统计学意义(P=1.05E-06<0.01);SPOP的表达在正常组对高加索人组和正常组对非裔美
国人组中,P值分别为P=5.437E-04<0.01和P=5.382E-03<0.01,差异极显著且有统计学意义(P<0.01);SPOP的表
达在正常组与格里森评分等于6、7、8、9的组间分别比较,P值分别为4.24E-05、2.27E-06、1.95E-06和2.04E-07,
差异均极显著,有统计学意义(P<0.01);SPOP表达在正常组与无区域淋巴结转移组和有区域淋巴结转移组间的比
较,P值分别为1.390E-06和4.244E-07,差异极显著,均具统计学意义(P<0.01);SPOP表达在正常组与TP53突
变组及TP53非突变状态组间的比较,P值分别为3.620E-06和9.703E-07,差异极显著,均具统计学意义(P<0.01)。
2.经Log-Rank检验比较得到,患者SPOP的表达水平基于格里森评分是其预后的不良因素,差异极显著,有统计学
意义(P<0.01)。结论:1.SPOP在前列腺癌中是作为抑癌基因存在的,此基因突变会促进前列腺癌的发生发展。2.前
列腺癌患者的发病和死亡与其所在地域和种族密切相关。3.临床诊断应重视SPOP突变检测。

关键词


前列腺癌;SPOP;基因表达;预后生存

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参考


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DOI: http://dx.doi.org/10.12361/2705-0459-04-06-92710

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